Adobe Flash Player のサポートは2020年12月31日で終了しました。（参考情報をご参照ください。）
OS付属のAdobe Flash Player をアンインストールする場合は、以下のいずれかの手順を実施してください。

■マンスリーロールアップの適用と共に Adobe Flash Player を削除する場合
マンスリーロールアップを適用することで Adobe Flash Player をアンインストールすることができます。マンスリーロールアップは、以下の2つの方法で適用できます。なお、マンスリーロールアップ適用後、OSの再起動が必要です。

○Windows Update を使用する場合
Windows Update を使用すると、最新のマンスリーロールアップを適用できます。2021年7月13日以降のマンスリーロールアップには、Adobe Flash Player をアンインストールする処理が含まれています。

○Windows Update を使用しない場合
Microsoft Update カタログからマンスリーロールアップを手動でダウンロードして適用します。

各OSのマンスリーロールアップの一覧は、以下のマイクロソフト社のサイトで確認できます。
Windows Storage Server 2012/Windows Storage Server 2012 R2 の場合、2021月7月13日以降のマンスリーロールアップを適用してください。Windows Storage Server 2019 の場合、2021年7月13日以降であればどれでも構いません。

[Windows Storage Server 2012]
Windows Server 2012 の更新履歴
https://support.microsoft.com/ja-jp/help/4009471

[Windows Storage Server 2012 R2]
Windows 8.1 および Windows Server 2012 R2 の更新履歴
https://support.microsoft.com/ja-jp/help/4009470

[Windows Storage Server 2019]
Windows 10 および Windows Server 2019 の更新履歴
https://support.microsoft.com/ja-jp/help/4464619

■マンスリーロールアップの適用を行わず、Adobe Flash Player のみを削除する場合
以下のURLにアクセスし、各OS用(*)の Adobe Flash Player 削除用の更新プログラム(KB4577586)を手動でダウンロードして適用してください。なお、更新プログラム(KB4577586)適用後、OSの再起動は不要です。
https://www.catalog.update.microsoft.com/Search.aspx?q=KB4577586%20Windows%20Server
*：Windows Storage Server には、同じバージョンの Windows Server の更新プログラムが適用可能です。

●参考情報（マイクロソフト社のAdobe Flash Player サポート終了の情報）
更新: Adobe Flash Player サポート終了 (2020 年 12 月 31 日)
https://docs.microsoft.com/ja-jp/lifecycle/announcements/update-adobe-flash-support

●補足
Windows Storage Server 2016 には OS 付属の Adobe Flash Player は存在せず、インストールできません。