COBOL85アプリケーションによるCOMMIT/ROLLBACKを禁止し、すべてDBリンクキットの表対応テーブルの設定による自動COMMITを採用したいと思っています。
DBリンクキットによるCOMMIT発行は指定された回数ごとに1回実行されるようですが、実際の更新回数が、指定された回数に達しない状態で COBOL85アプリケーションがSTOPRUNとなった場合、DBリンクキットがCOMMIT命令を発行するのはどのタイミングでしょうか？また、更新結果を有効にするために、COBOL85アプリケーションによるCOMMIT発行は必要でしょうか？

指定された更新回数に達しない状態でCOBOL85アプリケーションがSTOPRUNとなった場合、DBリンクキットが自動的にCOMMIT命令を発行して、ファイルをクローズします。
（CLOSE命令発行時やCOBOL85アプリケーション終了時には、内部的にCOMMIT命令を実行してから、ファイルのクローズを行います）

DBリンクキットヘルプ（以前のバージョンとの相違点→COMMITモード「自動」でCLOSE命令が発行されなかった 場合の問題修正）にも記述してありますので、そちらもご参照ください。

上記の通り、COBOL85アプリケーションの終了時には、DBリンクキット自身が自動的にCOMMIT命令を発行するので、COBOL85アプリケーションによるCOMMIT発行は必要ありません。ただし、最後の更新命令からファイルのクローズ（アプリケーションの終了）まで、かなり間があるようなアプリケーションや、各更新命令の間が長いアプリケーション（画面入力するような）では、その間に不慮の事故 （例えば、マシンのシャットダウン／DBリンクキットやDBのサービスダウン等）があった場合、最後の更新内容がCOMMITされない恐れがありますので、明示的に最後の更新命令を発行した直後にアプリケーションからCOMMIT命令を発行した方が無難かもしれません。