ftサーバは業務引継ぎのためにAPの改造やスクリプトを作成する必要はありますか？

ftサーバではそれぞれのモジュールが同じ処理を同時に行っていますのでAP側から障害による切り替えを意識する必要はありません。
クラスタでは、処理が他のサーバに移ります。このときに元のサーバで行っていた処理を復旧するためにはAP側で意識する必要があります｡