入力ファイル、出力ファイルに同じファイルを指定してソートすることが可能でしょうか？

入力ファイルと出力ファイルに同じファイルを指定する事が可能です。

なお、システムダウンなどによりソートの実行途中で処理が中断されますと、入力ファイル(出力ファイル)の内容は保証されません。
重要なファイルの場合は、あらかじめバックアップを取っておくか、出力ファイルを 別に指定することを推奨いたします。