システムの老朽化に伴い、ＨＷ更新を検討中です。アプリケーション機能に不満がないので、極力現行資産を活かしたいと考えています。

現行ではSolarisで運用していますが、Linuxへのマイグレーションを考えています。
Linuxへのマイグレーションにあたって、BATOOLで作ったソースを、BATOOL側でLinuxで動くソースを生成するよう にできないでしょうか？

可能です。
そもそも、BATOOLの生成コードはUNIX系OSで統一されており、Solaris用のソースとLinux用のソースは同一です。
BATOOLではOSやハードに依存するコードは生成していません。

【確認済みのバージョン】全バージョン
【確認済みの対象OS】全OS