「お気に入りのWebサイトポートレット」をテンプレートとして作成したポートレット内のリンクの開かれ方が、ブラウザによって異なります。
IE(Internet Explorer)6は新規ウィンドウにて開かれますが、IE7以上ではポータルを表示しているウィンドウと同一ウィンドウの別タブで開かれます。
これを、常に別ウィンドウで開かせることはできますか？

StarOffice X ポータルでは、リンクを新規ウィンドウで開くか、別タブで開くか制御は行っておりませんので、この現象はIEの設定に依存していると考えられます。
インターネットオプションの「タブブラウズの設定」にて、項目「ポップアップの発生時」のアクションを「常に新しいウィンドウでポップアップを開く」に設定することで、常に別ウィンドウで開かれるようになります。

対象バージョンは以下の通りです。
 - StarOffice X V1.0 - V2.0