StarOffice21(ベースサーバ)からStarOffice Xへの移行時にオフィスIDを変更しようとしています。
キャビネット／掲示板のデータを移行する時に、パスを指定してロードしようとしています。

例
SO21：OFC01
↓
SO-X：OFFICE01

上記例で移行元のStarOffice21環境においてOFC01にある文書に対するショートカットがあった場合、移行先のStarOffice Xではそのショートカットのリンクは切れませんか？

リンク切れにはなりません。
ショートカットはオフィスIDを使用していないのでオフィスIDが変更されてもショートカットは使用できます。

なお、移行時にショートカットが切れる条件はいくつかありますので、『StarOffice X 移行手順書』をご確認ください。

対象バージョンは以下の通りです。
 - StarOffice X V1.0以降のバージョン