IFASファイルを新規作成する際、小文字でファイル名を指定しても、大文字に変換されてファイルが作成されてしまいます。
ifas_create_is()関数に、小文字でファイル名を渡しているのですが、大文字のファイル名でファイルが作成されます。これはIFASPROの仕様でしょうか？

はい、IFASPROの仕様です。
Windowsのファイルシステムは大文字/小文字を区別しないため、大文字で作成します。

【確認済みのバージョン】すべて
【確認済みの対象OS】Windows