ファイル管理ユーティリティでファイルを選択して[ファイルコピー起動]ボタンを押しました。ファイル管理ユーティリティを終了しても、起動したファイルコピーユーティリティが終了しません。

ファイル管理ユーティリティを終了しても、起動したファイルコピーユーティリティは終了しません。
本ユーティリティから起動した、 
・ファイルコピーユーティリティ
・インデックスメンテナンスユーティリティ
は、それぞれのユーティリティで終了してください。