以下のコマンド例を参考に、VMware ESXiのコマンドコンソールからrmコマンドを実行し削除してください。
このとき、誤って目的外のファイルを削除しないよう注意してください。
# cd (コピーしたファイルの格納パス)
# rm (コピーしたファイル名)
もしくは、vSphere ClientやHost Clientのデータストアブラウザを使って、目的のファイルを削除してください。
OSバージョンや使用するソフトウェアにより表示や操作が異なるため、具体的な操作方法はvSphere ClientやHost Clientなど各ソフトウェアのマニュアルをご確認ください。