Windows Server 2012(R2含む)製品では、Windows Defender は、
搭載されていない機能となりますため、対応する必要はございません。
Windows Server 2016 製品では、既定で Windows Defender が
インストールされており機能しています。
他のアンチウィルスソウフトウェアをご利用されている場合は、
Windows Defender は、削除いただいても問題ございません。
Windows Server 2016 の Windows Defender ウイルス対策
https://docs.microsoft.com/ja-jp/windows/security/threat-protection/windows-defender-antivirus/windows-defender-antivirus-on-windows-server-2016